COVID-19 Pandemisi Sırasında Yoğun Bakım Ünitelerinde Bulaş Oranları Arttı mı?
Pandeminin kan kültürü kontaminasyon oranlarına etkisi
DOI:
https://doi.org/10.5281/zenodo.10019782Anahtar Kelimeler:
COVID-19,- Kan Kültürü- Koagülaz Negatif StafilokokÖzet
Amaç: Bu çalışmada, COVID-19 pandemisinin; yoğun bakım ünitelerinde(YBÜ) uzamış yatış süreleri, çeşitli ilaçların farklı rejimlerde kullanılması ( yüksek doz streoid gibi), artmış iş yükü, hızlı hasta sirkülasyonu gibi nedenlerle , pandemi öncesi döneme kıyasla YBÜ’lerinde kan enfeksiyonlarına neden olabilecek bakteriyel patojen dağılımında ve kontaminasyon oranlarında herhangi bir değişikliğe neden olup olmadığını irdelemeyi amaçladık.
Gereç ve Yöntem: Çalışmamızda; hastanemiz COVID-19 YBÜ’lerinin aktif olarak hizmet verdiği 1 Nisan 2020-31 Mart 2022 tarihleri arasında bu YBÜ’lerinde yatan orofaringeal, nazofaringeal sürüntülerinde gerçek zamanlı ters transkriptaz polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) testi pozitif olan ya da PCR testi negatif olup, klinik olarak COVID-19 tanısı düşünülen hastaların kan kültürlerinde üreyen mikroorganizmalar ve kan kültürü kontaminasyon oranları ile pandemi öncesi dönem (PÖD) olarak kabul ettiğimiz 1 Mart 2018-29 Şubat 2020 tarihleri arasında çeşitli YBÜ’de yatan hastaların kan kültür üremeleri ve kontaminasyon oranları karşılaştırılmıştır
Bulgular: Çalışmamızda PD’nde laboratuvarımıza COVID-19 yoğun bakım kliniklerinde takip edilen 1092 hastadan alınan 2475 kan kültürü gelmiştir. Bu hasta grubunun 640’ı erkek, 452’si kadındı. Yaş ortalamaları ise 70.23(18-100) olarak hesaplanmıştır. PÖD’de ise hastanemiz farklı yoğun bakım kliniklerinden laboratuvarımıza 1968 hastadan toplam 5854 kan kültürü gelmiştir. Bu hastaların ise 1164’ü erkek, 804’ü kadındı. Yaş ortalamaları ise 63.16 (0-99) olarak hesaplanmıştır. PÖD’de gelen numunelerin %57.87(3388)’sinde üreme tespit edilmedi, %38.81(2272)’inde etken mikroorganizma soyutlandı. Kontaminasyon oranı ise %3.31(194)'di. PD’de ise gelen numunelerin %48.81(1208)’sinde üreme tespit edilmedi, %28.89(715)’inde etken mikroorganizma soyutlanırken kontaminasyon oranı ise %22.30(552) olarak hesaplandı. PD’de en sık izole edilen etken bakteri Klebsiella pneumoniae (%24.34) olarak tespit edildi. PÖD’de ise en sık izole edilen etken bakteri ise Staphylococcus epidermidis(%17.05) olarak tespit edildi.
Sonuç: Sonuç olarak çalışmamızda kan kültürlerinde en sık üreyen bakterilerin KNS’ler olduğu görülmüştür. KNS’ler genel olarak kontaminant olarak kabul edilen izolatlardır. PD ve PÖD kıyaslandığında kontaminasyon oranlarında ciddi bir artış söz konusudur.
İndirmeler
Referanslar
Felsenstein S, Herbert JA, McNamara PS, Hedrich CM. COVID-19: Immunology and treatment options. Clinic Immun. 2020: 108448.
Topcu AW, Söyletir G, Doğanay M, editörler. Enfeksiyon Hastalıkları ve Mikrobiyolojisi Etkenlere Göre Enfeksiyonlar. İstanbul: Nobel Tıp Kitapevleri; 2017.
Gürlevik SL. Koronavirüsler ve Yeni Koronavirüs SARS-CoV-2. Cocuk Enf Derg. 2020; 14(1): 46-8.
COVID-19 (SARS-CoV-2 Enfeksiyonu) Genel Bilgiler, Epidemiyoloji ve Tanı. Ankara: T. C. Sağlık Bakanlığı Halka Sağlığı genel Müdürlüğü [Son güncellenme tarihi: 07.12.2020; 15.03.2021]. https://covid19.saglik.gov.tr/Eklenti/39551/0/COVID19rehberigenelbilgilerepidemiyolojivetanipdf.pdf
Ntusi N, Aubin L, Oliver S, Whitelaw A, Mendelson M. Guideline for the optimal use of blood cultures. S Afr Med J 2010; 100(12): 839-43.
Chiarini A, Palmeri A, Amato T, Immordino R, Distefano S, Giammanco A. Detection of bacterial and yeast species with the Bactec 9120 automated system with routine use of aerobic, anaerobic, and fungal media. J Clin Microbiol 2008; 46(12): 4029-33.
Hall KK, Lyman JA. Updated review of blood culture contamination. Clin Microbiol Rev 2006; 19(4): 788- 802.
Darge`re S, Cormier H, Verdon R. Contaminants in blood cultures: importance, implications, interpretation and prevention. Clin Microbiol Infect. 2018;24(9):964–9.
Zhu NJ, Rawson TM, Mookerjee S, et al. Changing patterns of bloodstream infections in the community and acute care across 2 coronavirus disease 2019 epidemic waves: a retrospective analysis using data linkage. Clin Infect Dis. 2021;1–10:ciab869. https://doi.org/10.1093/cid/ciab869.
Ohki R, Fukui Y, Morishita N, Iwata K. Increase of blood culture contamination during COVID-19 pandemic. A retrospective descriptive study. Am J Infect Control. 2021;49(11):1359–61.
Sieswerda E, de Boer MGJ, Bonten MMJ, et al. Recommendations for antibacterial therapy in adults with COVID-19 – an evidence based guideline. Clin Microbiol Infect. 2021;27(1):61–6.
Damonti L, Kronenberg A, Marschall J, et al. The effect of the COVID-19 pandemic on the epidemiology of positive blood cultures in Swiss intensive care units: a nationwide surveillance study. Crit Care. 2021;25:403.
Cunha BA, Lortholary O, Cunha CB. Fever of unknown origin: a clinical approach. Am J Med. 2015;128(10):1138.e1-1138.e15.
Wright WF, Auwaerter PG. Fever and fever of unknown origin: review, recent advances, and lingering dogma. Open Forum Infect Dis. 2020. https://doi.org/10.1093/ofid/ofaa132.
Caldero´n-Parra J, Muin˜o-Miguez A, Bendala-Estrada AD, et al. Inappropriate antibiotic use in the COVID-19 era: Factors associated with inappropriate prescribing and secondary complications. Analysis of the registry SEMI-COVID. PLoS ONE. 2021;16(5): e0251340.
Epidemiology Working Group for NCIP Epidemic Response, Chinese Center for Disease Control and Prevention. The epidemiological characteristics of an outbreak of 2019 novel coronavirus diseases (COVID-19) in China. Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2020;41(2):145-51. https://doi.org/10.3760/ cma.j.issn.0254-6450.2020.02.003
Zhou F, Yu T, Du R, et al. Clinical course and risk factors for mortality of adult inpatients with COVID-19 in Wuhan, China: a retrospective cohort study. Lancet. 2020;395(10229):1054-62.
Nori P, Cowman K, Chen V et al. Bacterial and fungal coinfections in COVID-19 patients hospitalized during the New York City pandemic surge. Infect Control Hosp Epidemiol 2021; 42: 84-8.
Tiri B, Sensi E, Marsiliani V et al. Antimicrobial Stewardship Program, COVID-19, and Infection Control: Spread of Carbapenem-Resistant Klebsiella Pneumoniae Colonization in ICU COVID-19 Patients. What Did Not Work? J Clin Med 2020; 9: 2744
Lansbury L, Lim B, Baskaran V, Lim WS. Coinfections in people with COVID-19: a systematic review and meta-analysis. J Infect 2020; 81: 266- 75.
Langford BJ, So M, Raybardhan S et al. Bacterial co-infection and secondary infection in patients with COVID-19: a living rapid review and metaanalysis. Clin Microbiol Infect 2020; 26: 1622
Sepulveda J, Westblade LF, Whittier S et al. Bacteremia and Blood Culture Utilization during COVID-19 Surge in New York City. J Clin Microbiol 2020; 58
Goyal P, Choi JJ, Pinheiro LC et al. Clinical Characteristics of Covid-19 in New York City. N Engl J Med 2020; 382: 2372-4.
Tosun Mİ, Küçük B, Aral M. COVID-19 PCR Pozitif Hastaların Kültür Sonuçlarının Değerlendirilmesi. Fırat Tıp Dergisi 2022; 27(3): 209-212.
Aytaç Ö, Şenol FF, Şenol A, Öner P, Aşçı Toraman Z. COVID-19 pandemisi öncesi ve sırasında yoğun bakım ünitesi hastalarından alınan kan kültürü izolatlarının tür dağılımı ve antibiyotik duyarlılık profillerinin karşılaştırılması. Turk Mikrobiyol Cemiy Derg. 2022;52(1):39-47.
Küçükateş E, Gültekin N. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antimikrobiyal duyarlılıkları. Haseki Tip Bul. 2016;54(2):97-102. https://doi.org/10.4274/haseki.2872
Ece G. Kan kültüründe üreyen izolatların dağılım ve antibiyotik duyarlılık profilinin incelenmesi. Haseki Tıp Bülteni. 2013;51:151-6.
Gülmez D, Gür D. Hacettepe Üniversitesi İhsan Doğramacı Çocuk Hastanesi'nde 2000-2011 yılları arasında kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar: 12 yıllık değerlendirme. J Pediatr Infect. 2012;6:79-83.
Çopur Çiçek A, Şentürk Köksal Z, Ertürk A, Köksal E. Rize 82.Yıl Devlet Hastanesi'nde bir yıllık sürede kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları. Türk Hij Den Biyol Derg. 2011;68:175-84
Morkel G, Bekker A, Marais BJ, Kirsten G, vanWyk J, Dramowski A. Blood stream infections and antimicrobial resistance patterns in a South African neonatal intensive care unit. Paediatr Int Child Health. 2014;34:108-14
Hoenigl M, Wagner J, Raggam RB, Prueller F, Prattes J, Eigl S et al. Characteristics of hospital-acquired and community-onset blood stream infections, SouthEast Austria. PloS One. 2014;9:e 1047
Reimer LG, Wilson ML, Weinstein MP. Update on detection of bacteremia and fungemia. Clin Microbiol Rev. 1997;10:444-65.
Kılınç Ç, Güçkan R, Kahveci M, Kayhan Y, Pirhan Y, Özalp T. Kan kültürlerinde üreyen gram negatif izolatların dağılımı ve antibiyotik direnç profilleri. Int J Basic Clin Med. 2015;3(3):125-30.
Barış A, Bulut ME, Öncül A, Bayraktar B. Distribution of clinical isolates at species level and their antibiotic susceptibilities in intensive care units patients. Türk Yoğun Bakım Derneği Dergisi. 2017;15(1):21-7
Şirin MC, Ağuş N, Yılmaz N, et al. Yoğun bakım ünitelerinde yatan hastaların kan kültürlerinden izole edilen mikroorganizmalar ve antibiyotik duyarlılıkları. Turk Hij Den Biyol Derg. 2017;74(4):269-78. https://doi.org/10.5505/TurkHijyen.2017.94899
İndir
Yayınlanmış
Nasıl Atıf Yapılır
Sayı
Bölüm
Lisans
Telif Hakkı (c) 2023 Chronicles of Precision Medical Researchers
Bu çalışma Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License ile lisanslanmıtır.
